孝武帝刘骏任命沈庆之在桑里准备三堆烽火，假如攻克广陵外城，就点燃一堆烽火，攻克内城就点燃二堆烽火，活捉刘诞就点燃三堆烽火，加盖皇帝玺印的诏书督促前进，前后不断地送来。沈庆之焚烧广陵东门，填塞壕沟建造攻城的道路，树起行楼、土山等各种攻城器具，不料遇上长时间下雨，却不能攻城。
刘骏派遣御史中丞庾徽之上奏请求罢免沈庆之的官职，刘骏则故意下诏表示不想过问此事，想以此来激将沈庆之。一直从春四月到秋季的七月份，雨终于停止，广陵城仍然还未攻下来。刘骏发怒了，于是命令太史选择吉日，打算亲自渡江讨伐刘诞，太宰刘义恭坚决劝阻才停止未去。
刘诞开始时关闭城门拒绝朝廷的使者入城，记室参军山阴人贺弼坚决劝谏，刘诞发怒了，抽出佩刀直向贺弼胸膛，贺弼这才停止谏争。后来刘诞派兵出城作战屡次被战败，部下将佐多有翻越城墙出城投降的，有人劝贺弼应早点出城躲避灾祸，贺弼说：“公举兵与朝廷作对，此事已不可跟从，但蒙受公的厚恩，道义上又不能违背他，只应以死来表明我的心迹。”
于是喝下毒药自杀，参军何康之计划打开城门迎接官军，但没有成功，便杀死收关士兵出城投降了。刘诞建造高楼，把何康之的母亲绑在高楼上，暴露在风雨中，也不给食物。母亲一直呼叫何康之的名字，几天之后就死去了。
刘诞任命中书长史濮阳人范义为左司马，范义的母亲和妻子儿女都在广陵城内，有人对范义说：“大事必定不会成功，你为什么不逃跑呢？”
范义说：“我是王府的官吏，何况儿子不能抛下母亲不管，官吏亦不能抛弃主人。如果要像何康之那样活着，我是不干的。”
沈庆之带领军队攻城，身先士卒亲自顶着箭石攻打，终于攻克了广陵外城，乘胜前进又攻克内城。刘诞听说朝廷军队已经进城，慌忙逃到后园躲起来，队主沈胤之等人追上他，用剑击伤刘诞坠落水中，于是拉他出来将他杀死，刘诞的母亲妻子都自杀。
刘骏听说广陵城已被攻下，这才走出宣阳门，叫左右的人们都高呼万岁。侍中蔡兴宗陪同刘骏乘车，刘骏回头问他：“独独你为什么不喊？”
蔡兴宗严肃地说：“陛下今天正应该哭泣着诛杀罪人，岂能都喊万岁！”
刘骏心里很不高兴，然后下诏把刘诞贬为姓留，广陵城中的士民百姓，无论老小全都被杀死。沈庆之请求自身高五尺以下的人留下不杀，其余的男子都可以杀死，女子则都充作军赏，即使这样也还是杀了三千多人。
沈庆之不识字，家产一向富裕，产业积聚万金以上，僮吏奴仆数以千计，又向朝廷献钱一千万，谷一万斛。先有四处宅院，又有花园房屋在娄湖，一天黄昏，沈庆之带着子孙及其表亲戚迁居娄湖，把另外四处宅院捐献官府。沈庆之有很多妓女小妾，悠闲游玩没有事做，尽情欢娱的事，不是朝见或庆贺大会就不出门。出门时的车马装饰一律朴素，随从的人不过三五个，见到他的人不知道他是三公高官。
长水校尉宗越亲临刑场负责杀人，都先剖腹挖眼，或鞭打脸面肌腹，再用苦酒灌在伤口上，然后才斩首，宗越面对这种酷刑屠杀好像十分得意。宗越治军严厉，善于部署营阵，每次数万人行军停驻，宗越自己骑马在前面走，让军队跟随其后，宗越的马一停下来，阵营就已经布置好，不曾出现过差错。
刘骏把斩下的人头都堆积在石头城，依靠长江南岸做成高堆以显耀军威，侍中沈怀文向刘骏劝谏，但刘骏还是没有同意。当初，刘诞自知将会失败，让黄门吕昙济与左右亲信带着世子刘景粹到民间躲藏，对他们说：“大事如果不成功，想请你们保全景粹。如果不免被杀，可深深埋葬他。”
然后分别送给他们金银财宝随身携带护送刘景粹，他们出了城门之后，却都各自逃散了，只有吕昙济从不离开刘景粹，带着刘景粹多了十几天之后，才被抓获杀死。临川内史羊璿因与刘诞一向友善而受连累，也被抓进监狱而死。
于是刘骏提拔梁旷为后军将军，追赠刘琨之为给事黄门侍郎。任命丹杨尹刘秀之为尚书右仆射，任命南兖州刺史沈庆之担任司空，南兖州刺史仍旧保留。蔡兴宗奉旨去慰劳攻克广陵城的部队，蔡兴宗与范义一向友好，就收敛了范义的尸体，送范义的丧事回到豫章，刘骏对蔡兴宗说：“你怎么敢故意触犯王法？”
蔡兴宗顶撞说：“陛下自家杀贼，臣自家收葬故人，怎么有什么不可以！”
宋国前庐陵内史周朗向刘骏提意见时痛切直率，刘骏怀恨他，让有关部门弹劾周朗，因为其母亲守丧时不符合礼节，就叫人从家乡押送宁州，在路上杀死周朗。周朗上路时，侍中蔡兴宗正在值班，请求去与周朗告别，由于犯了条规，罚以平民身份兼任官职。
当初东扬州刺史颜竣因母亲逝世奔丧回建康，刘骏恩宠他的待遇十分丰厚，颜竣时常对亲近的旧友讲些埋怨的话，有时就论及朝廷政治的得失。正遇上王僧达被治罪，他怀疑是颜竣在背后说他的坏话造成的。将要处死时，王僧达把颜竣前后讲过的愤恨诽谤刘骏的话，全部报告给有关部门。
刘骏于是让御史中丞庾徽之弹劾颜竣，罢免了颜竣的官职。颜竣更为害怕了，向刘骏上书表示谢罪，并且要求活命，刘骏更为生气，下诏回答说：“你诽谤怨恨已辜负了我对你的期望，却又过分地费心顾虑，怕不能活命，这难道是下级奉事上级忠诚节操的表现吗？”
到竟陵王刘诞反叛，刘骏于是诬陷颜竣与刘诞通谋，于是逮捕颜竣交付廷尉，先砍断颜竣的脚，然后赐他自杀。妻子儿女流放到交州，走到宫亭时，又把其家的男子全部沉入湖中淹死。
这一日宣布大赦，刘骏诏命营建明堂，只在南方和中心方位建一座大殿，大殿格局与太庙一样，只是分为十二间，与太庙有些不同。当初，晋朝人在南郊巳位筑祭坛，尚书右丞徐爰考虑这不合乎礼制，刘骏下诏把祭坛移到牛头山西面，位于正对着宫城的午位。到废帝刘子业即位时，认为原来的巳位吉利，又把祭坛迁回到远处。这时刘骏又命尚书左丞荀万秋建造五路，都按照金根车的惯例，另外在车上加上羽毛车盖。
刘骏亲自耕种藉田，祭祀祖庙，第一次乘坐玉路，又在建康玄武湖北面筑建上林苑。册立皇子刘子勋为晋安王，刘子房为寻阳王，刘子顼为历阳王，刘子鸾为襄阳王。皇后亲自在西郊采摘桑叶，皇太后亲临观看典礼。
春正月初一，文武百官聚集朝廷进行庆贺新年，雪花飘落在太宰刘义恭的衣服上。这雪花有六瓣，刘义恭向刘骏上奏说这是祥瑞，刘骏非常高兴。而刘义恭因为刘骏生性多疑残暴，害怕他不能够容纳自己，常常言辞卑谦脸色恭顺，曲意敬奉刘骏，因此在刘骏即位期间，才能免于祸害。
刘义恭年老成精，用牺牲尊严而获取了活命，相较年轻的宗室就没有那么聪明了，比如雍州刺史、海陵王刘休茂。刘休茂是刘义隆的第十四子，年龄只有十七岁，王府的司马庾深之代行王府政务。刘休茂性情急躁，想自己专掌政务的处理，庾深之及王府的主帅常常阻止他，刘休茂心怀怨恨。
刘休茂的亲随张伯超受到宠信，多有罪恶行为，主帅多次谴责他。张伯超害怕了，对刘休茂说：“主帅暗地记录你的过失，想向皇帝汇报，这样恐怕没有好结果。”
刘休茂说：“对此该怎么办呢？”
张伯超说：“只有杀了行事司马和主帅，举兵自卫。这里离都城几千里，纵使大事不能成功，不失为逃入北方去当一个大王。”
刘休茂同意了他的意见，这天夜里，刘休茂与张伯超等率领夹毂队，在城中杀死了典签杨庆，又出城杀死了庾深之和典签戴双，征集兵众树起牙旗，驰传檄文，使部下官吏为自己上官号为车骑大将军、开府仪同三司，加授帝王专用攻打的铜斧。侍读博士荀诜劝阻，刘休茂杀死了他。张伯超专擅军政大权，生杀大权都在自己手中，引得人心离散。刘休茂的亲随曹万期挺身砍杀刘休茂，不得成功也被杀死。
刘休茂出城行军驻营，咨议参军沈畅之等率领军队关闭城门抗拒刘休茂，刘休茂飞驰返回不能进入城中。义成太守薛继考替刘休茂尽力攻城，，一举攻克了城守，斩杀了沈畅之及其同谋几十人。这一天，参军尹玄庆又起兵反击刘休茂，并活捉了刘休茂斩首。他的母亲妻子都自杀，同谋的人都被杀死。
这时城中一片混乱，没人统领管理，中兵参军刘恭之是刘秀之的弟弟，众人都推举他代行王府雍州政务。薛继考带兵威逼刘恭之，让他发布公告说薛继考匡扶正义号召平叛。然后薛继考自己乘坐驿站马匹返回建康谎报事宜，刘骏任命薛继考为北中郎咨议参军，还赐给冠军侯的爵位。可事情很快就暴露了，薛继考伏罪被杀。